TOF-DR软件的数据分析拥有四个程序模块：Spectrum analysis、Image analysis、Profile analysis以及3DImage analysis。为了方便大家更好地使用TOF-DR软件，本系列文章将会和大家分享一些数据处理的常用功能及技巧。
首先，本文将介绍Spectrum analysis模块常用功能的基本操作。如图1所示，该模块又可分为5个部分，可完成对常规质谱数据的处理。
图1. Spectrum analysis基本界面：1-菜单栏和工具栏；2-特定功能图标；3-数据列表；4-谱图显示窗口；5-谱图水平刻度扩展窗口。
一、数据的导入/导出
图2. 数据打开与保存界面
数据导入: 通过图2功能栏的【Playback】或工具栏的Open实现
1.左键点击【Playback】按钮，在页面的【Raw File】中选择原始【*.raw】文件，点击【Start】完成数据回溯。此外，可通过Playback页面的【Limit by Time or Cycle】和【Regions of Interest】，选择设置回溯的起始/终止时间、层数及感兴趣区域等。
2.点击【Open】选择【.tdc】文件，只打开质谱数据，无image、profile信息。
质谱数据导出:通过菜单栏File的Save As来实现
左键单击要保存的数据，列表处数据框变为黄色，再逐一点击【File】-【Save As】-OK，就可选择性地将数据保存为三种格式，后缀分别为：
.tdc：将原始数据保存为质谱⽂件，可通过TOF-DR的Spectrum analysis界面打开，该文件格式仅保存质谱信息，后续不能从.tdc格式文件回溯出mapping和深度曲线；
.asc：未经压缩的质谱数据，以ASCII格式编码，可导出最高质量精度的质谱数据，该格式文件可通过记事本、Excel和Origin等软件打开。打开后的文件包括三列信息，第一列对应二次离子到达检测器的飞行时间，第二列对应质荷比m/z，第三列对应二次离子信号强度counts。
.Asc：压缩后的质谱数据，可将原始质谱数据中的二次离子质荷比压缩为整数位导出，且导出的质量范围可自定义。
质谱数据快速导出：通过功能栏【Slides】或【Edit】导出至PowerPoint：
除了直接导出ASCII格式编码的质谱数据之外，Spectrum analysis模块还可以快速将质谱图直接导出至PPT，并进行后续编辑。主要有两种方法，如图3所示：
图3. Slides Preview界面
1.点击功能栏【Slides】，进入【Slides】界面后可导出已打开的谱图数据。该界面左上角【Params】为谱图尺寸、字体等参数的设置按钮，中间【Select Template】为选择模板，右侧为spectrum预览区域（header、坐标范围、放大倍数、标签等均可进行自定义）。最后单击【Export Slide】按钮将编辑好的谱图导出到PPT，完成图表和曲线的绘制。
2.点击Spectrum analysis界面左上角的【Edit】，在弹出的下拉框中选择【Copy to PowerPoint】，将以图片形式导出当前Spectrum analysis界面所显示的所有谱图数据。注意，导出前可在该窗口完成对谱图尺寸、颜色、字体大小等参数的修改，也可粘贴到PPT后再对其进行编辑。
* 注意：在使用【Slides】和【Copy to PowerPoint】功能导出数据时，请确认电脑中已安装激活后的office办公套件，该功能对WPS兼容性较差，不能确保数据可以正常导出至WPS。
二、谱图界面调整/缩放
图4. 单个质谱图的调整/缩放界面
如图4所示，在TOF-SIMS质谱图中，有X和Y方向上两个维度的质谱信息：X轴代表谱峰的质量范围-质荷比(m/z)，Y轴代表二次离子的信号强度(counts)。可通过以下方式对质谱界面进行调整或缩放：
X/Y轴平移：使用鼠标左键按住谱图X/Y坐标轴并进行拖动，可使X/Y轴数据整体平移。
X/Y轴缩放：使用鼠标右键按住谱图X/Y坐标轴并进行拖动，可使坐标轴刻度以起点为中心，进行放大/缩小，向右拖动可放大X/Y坐标轴范围，向左拖动可缩小X/Y坐标轴范围。
X/Y轴精确调整：右键单击谱图X/Y轴坐标，弹出X/Y-Axis Bounds窗口，可直接输入数值并回车，可精确选择X/Y轴显示范围。
X轴局部放大：当高质量段谱峰信号较弱时，可使用功能栏【Expander】放大器功能放大某一质荷比之后的谱峰信号强度，放大起点与倍数均可手动调整。
此外，在处理多个质谱数据时，还有一些界面调整小技巧，如下图所示：
图5. 多个质谱图的缩放界面
1. 多组数据统一X轴范围：如图5所示，在显示多组质谱数据时，如果想要统一多组数据的X轴坐标显示范围，可选中某一组数据，并将【】拖放于其他组，就可以所选择数据的X轴坐标范围应用到下一组数据；另外，在打开多组数据时，点击Mass-Link按钮【】，即可将多组数据的X轴锁定在统一的质量范围。
2. 谱峰局部放大：在大质量范围很难去分析特定谱峰时，可使用子图功能对谱图特定质量范围的谱峰进行局部放大。如图5所示，点击【Cursor】按钮将选峰方式变为双光标，再使用鼠标左键左右拖动左右两侧的红色光标，将想要仔细观察的质量区间置于两个光标之间，点击【Spawn】按钮即可在谱图下方显示该质量区间放大后的质谱图。
3. Y轴自动缩放：如果不小心将Y轴坐标调乱了，找不到坐标零点，可点击【Scale】按钮，此时Y轴会自动缩放，将谱图恢复值原始刻度。
三、质量校准
图6. 质量校正界面
如图6所示，质量校准可通过以下步骤完成：
1.选择打开的质谱数据，点击【Calibrate】按钮。
2.添加/删除⽤于校准的峰。
添加：在【Formula】中输⼊化学式，点【Add Peak to Calib.List】按钮。例如要添加 CH3，输⼊ C+H3或C空格H3）。
删除：从右侧选择要删除的峰值，点【Delete Peak from Calib.列表】按钮删除。
3.使⽤双光标将列表中的每个峰选中，点【Update Peak in Calib】更新校准。
